Почему Толстой называет эти минуты лучшими это из 2 тома 3 части…?

Потому что у князя Андрея потерян смысл в жизни, он считает что нужно дать дорогу молодым, что он стар что бы что-то уже менять в своей жизни. Когда он видит дуб, который среди молодых цветущих деревьев чахнет, он сравнивает себя с ним. Но на обратном пути (после встречи с Наташей) он видит как дуб расцвел, и понимает что не все потеряно. Эпизод встречи князя Андрея Болконского со старым дубом является одним из поворотных мест в романе: это переход на новый этап жизни, полная перемена мировосприятия героя. Встреча с дубом — перелом в старой его жизни и открытие новой, радостной, в единении со всем народом.